Ngày 23/7/1968 Hội đồng Chính phủ ban hành Quyết định số 114/CP thành lập Phân hiệu Đại học Y khoa Thái Bình và ngày 24/01/1979 Hội đồng Chính phủ ban hành Quyết định số 34/CP chuyển Phân hiệu Đại học Y khoa Thái Bình thành Trường Đại học Y Thái Bình. Ngày 11/11/2013, Trường được Thủ tướng Chính phủ ký Quyết định số 2154/QĐ-TTg về việc đổi tên Trường Đại học Y Thái Bình thành trường Đại học Y Dược Thái Bình.
Trường Đại học Y Dược Thái Bình là đơn vị sự nghiệp trực thuộc Bộ Y tế, có tư cách pháp nhân, có con dấu và tài khoản riêng, có trụ sở đóng tại 373 phố Lý Bôn, thành phố Thái Bình - tỉnh Thái Bình.
- Đào tạo nguồn nhân lực thuộc nhóm ngành khoa học sức khoẻ ở trình độ đại học và sau đại học cho đất nước và hai nước bạn Lào và Campuchia. Đào tạo trung cấp chuyên nghiệp, các văn bằng, chứng chỉ khác theo nhu cầu xã hội. Tuyển sinh và quản lý người học. Phát hiện và bồi dưỡng nhân tài, tham gia các hoạt động xã hội.
- Nghiên cứu khoa học, phát triển công nghệ, kết hợp đào tạo với nghiên cứu khoa học, sản xuất, dịch vụ khoa học công nghệ trong lĩnh vực Y sinh học và một số lĩnh vực khác có liên quan.
- Khám chữa bệnh, thực hiện các chương trình, dự án về chăm sóc sức khoẻ nhân dân.
- Đào tạo và phát triển đội ngũ giảng viên của Trường đủ về số lượng, đạt tiêu chuẩn về chất lượng, cân đối về cơ cấu trình độ, ngành nghề, tuổi và giới; chăm lo đời sống tinh thần, vật chất của cán bộ.
Trường có 620 cán bộ. Trong đó có 431 cán bộ biên chế, 15 sĩ quan biệt phái, hợp đồng lao động 174 người. Số cán bộ giảng dạy có trình độ Sau đại học chiếm 86,4%, 01 giáo sư, 08 PGS, 37 TS (còn có 19 thạc sĩ đang làm NCS trong và ngoài nước), 16 BSCKII, 148 ThS, 13 BSCKI, 02 giảng viên cao cấp, 82 giảng viên chính, 03 Nhà giáo Nhân dân, 14 Nhà giáo Ưu tú, 11 Thầy thuốc Ưu tú. Có 266 cán bộ giảng dạy kiêm nhiệm thuộc các cơ sở thực hành của Nhà trường.
Cơ cấu tổ chức của Trường hiện nay gồm 11 phòng, ban chức năng; 03 khoa; 36 bộ môn; 02 Tổ Bộ môn; 06 Trung tâm; 03 đơn vị (Bệnh viện, Thư viện, Trạm Y tế).